Kompatybilność warstw oznacza, że podkład i nawierzchnia są dobrane tak, by dobrze się łączyły i nie powodowały wad powłoki (np. marszczenia, pęcherzy, odspajania). W praktyce wykonawczej dobiera się zestawy zalecane przez producenta lub sprawdzone układy, np. podkład tlenkowy pod nawierzchnię ftalową.