Przy porównywaniu dwóch warstw w geoportalu można zauważyć, że jedna z nich jest niekompletna względem drugiej. W praktyce geodezyjnej taka rozbieżność może mieć kilka przyczyn: inna data aktualizacji, inny zakres tematyczny/obszarowy, ograniczenia publikacji (np. uogólnienie) albo błąd w udostępnieniu danych.
Najbezpieczniejsze i profesjonalne postępowanie to zgłoszenie problemu do podmiotu odpowiedzialnego za publikację warstwy (administrator/gestor danych lub obsługa geoportalu). Dzięki temu możliwa jest weryfikacja u źródła, poprawa jakości danych oraz zachowanie spójności z metadanymi i wersjonowaniem.
Podejście polegające na "zignorowaniu" rozbieżności jest ryzykowne, bo może prowadzić do błędnych wniosków w opracowaniu lub w terenie (np. przy planowaniu pomiaru, analizie przebiegu granic czy interpretacji obiektów). Z kolei "usunięcie warstwy" w geoportalu nie rozwiązuje problemu danych, a jedynie ukrywa symptom i utrudnia porównanie źródeł.
Próba samodzielnego dodania brakujących danych do warstwy jest zazwyczaj nieuprawniona: użytkownik geoportalu najczęściej nie ma dostępu do edycji danych źródłowych, a nawet gdyby miał, wprowadzenie zmian bez procedury i bez potwierdzenia źródeł może naruszyć spójność bazy i wiarygodność opracowania. Dlatego właściwa jest ścieżka: identyfikacja rozbieżności, odnotowanie (co, gdzie, kiedy), a następnie zgłoszenie do właściwego podmiotu.
