Zatoka szczękowa należy do twarzoczaszki i znajduje się w obrębie szczęki, pod oczodołem. Na RTG jest to przestrzeń powietrzna, więc częściej widoczna jako przejaśnienie. Podstawa czaszki obejmuje m.in. okolice kości skroniowej, klinowej i potylicznej, czyli obszary położone bardziej ku tyłowi.